Cerita dimulai dengan pertarungan antara dua pahlawan lawan, ZET dan ALPHAS, dan kemudian melacak asal-usul mereka – Jin Kanzaki, seorang pemuda dengan kemampuan untuk berubah menjadi manusia super yang dikenal sebagai ZET, dan Kouga Amagi, seorang pemuda dengan rasa keadilan yang kuat yang menggunakan teknologi untuk bertarung sebagai ALPHAS. Nasib kedua orang ini dan orang-orang di sekitar mereka saling terkait saat mereka berjuang untuk melindungi umat manusia dan menghancurkan kekejian mengerikan yang dikenal sebagai Pemain.