Kimihiro Watanuki dapat melihat roh-roh dan berbagai makhluk gaib lainnya, yang merupakan kemampuan yang sangat menyebalkan yang sangat tidak ia sukai. Dalam perjalanan pulang suatu hari, ketika dihinggapi oleh beberapa roh, dia terpaksa masuk ke rumah yang aneh. Di sana, ia bertemu dengan Yuuko, seorang wanita misterius yang mengaku mampu menyingkirkannya dari kemampuan untuk melihat dan menarik makhluk-makhluk bermasalah