Yato dan Yukine akhirnya diperbaiki hubungan mereka sebagai tuhan dan Regalia, dan semua orang telah kembali ke kehidupan mereka sehari-hari. Yato tetap kecil dan tidak diketahui ketuhanan yang terus mengambil pekerjaan sambilan untuk lima yen masing-masing dengan harapan satu hari memiliki jutaan jamaah dan sendiri grand shrine. Hiyori Iki belum memiliki nya longgar jiwa diperbaiki oleh Yato, tapi dia menikmati hidup dan mempersiapkan untuk menghadiri sekolah tinggi tetap.Yang terjadi segera setelah musim pertama, Noragami Aragoto menggali rumit masa lalu antara Yato dan dewa perang Bishamon. Perempuan allah memegang misterius dendam terhadap Yato, yang sering mengakibatkan bentrokan antara mereka. Itu tidak membantu bahwa Bishamon yang paling dipercaya dan dicintai Regalia, Kazuma, tampaknya berhutang untuk Yato. Ketika hidup berada pada line, mengungkap misteri-misteri ini dan orang lain yang mungkin satu-satunya cara untuk memperbaiki kesalahan masa lalu.