Cerita ini berkisah tentang siswa sekolah menengah Akira Nikaido, seorang pemalas yang hidup normal. Begitulah, sampai ia bertemu dengan Shirogane yang misterius, seorang pria yang tiba-tiba muncul dan mengatakan kepadanya bahwa mereka memiliki takdir bersama. Ketika Akira mendengar ini, dia terkejut dan tidak percaya sepatah kata pun tentang itu. Aya, teman Akira, melupakan sesuatu di sekolah suatu malam, dan meminta Akira untuk membantunya dan pergi menemukannya. Dia setuju, dan sementara di sana, dia diserang oleh monster bayangan. Shirogane meyakinkannya bahwa keseimbangan antara dunia manusia dan dunia bayangan telah terdistorsi dan bahwa Akira harus menjadi ‘shin’ – makhluk dari dunia bayangan – untuk membantu memulihkan keseimbangan. Anime ini memiliki tema shonen-ai yang sama sekali tidak ada di manga.