Abad Universal 0096. Beberapa bulan telah berlalu sejak insiden seputar kotak Laplace yang juga dikenal sebagai Piagam Abad Universal. Pasukan Federasi Bumi mengirim sekelompok penyelidik ke Poros terputus yang melayang di luar Bumi Sphere. Dua warga sipil berpartisipasi sebagai anggota kelompok penelitian: Arlette Almage dan Danton Hyleg. Keduanya memiliki masa lalu dengan layanan pemerintah kepada Kerajaan Zeon dan Neo Zeon sebagai insinyur dan pilot uji. Setelah menyusup ke Axis, para penyelidik diserang di dalam markas yang seharusnya tidak ada orang. Arlette dan Dalton dihadapkan pada insiden yang tidak pernah mereka bayangkan.