Pada Februari 1999, serangkaian pembunuhan membuat Shiki Ryougi dan Mikiya Kokutou berada di ujung tanduk. Kejahatan ini memiliki kemiripan yang sangat mirip dengan serangkaian pembunuhan serupa sejak 1995, ketika Shiki dan Mikiya pertama kali bertemu, dan membangkitkan keinginan gelap yang membunuh yang telah membekas dalam jiwa Shiki sejak saat itu. Shiki dicurigai karena keterlibatannya dalam pembunuhan. pembunuhan masa lalu dan kemiripannya dengan si pembunuh, dia dan Mikiya berangkat untuk menemukan pelaku yang sebenarnya. Di tengah-tengah penyelidikan terpisah mereka, Mikiya tumbuh semakin peduli dengan kesejahteraan Shiki dan bergegas untuk menemukan orang yang bertanggung jawab untuk melindungi Shiki dari impulsnya sendiri. Dengan petunjuk yang ia terima dari sepupunya, penyelidik polisi Daisuke Akimi, Mikiya digiring ke perut bawah Kota Mifune, karena keselamatan jiwa Shiki terletak pada tekadnya untuk membuktikan bahwa ia tidak bersalah sekali dan untuk selamanya.