Shuuichi Nitori, siswa kelas lima yang bungsu, dianggap oleh sebagian besar sebagai salah satu gadis tercantik di sekolah, tetapi banyak yang membuatnya kecewa, dia sebenarnya secara biologis laki-laki. Untungnya, Shuuichi memiliki teman masa kecil yang memiliki perasaan tidak nyaman yang sama terkait dengan identitas gender: tomboi kurus Yoshino Takatsuki, yang, meskipun secara biologis perempuan, tidak mengidentifikasi sebagai seorang gadis. Kedua sahabat ini berbagi rahasia yang sama dan menemukan penghiburan satu sama lain; Namun, hidup mereka menjadi lebih rumit ketika mereka harus menginjak perairan yang tidak dikenal dari sekolah baru, berusaha untuk mendapatkan teman baru, dan berjuang untuk mempertahankan yang lama. Dihadapkan dengan peluang yang hampir tidak dapat diatasi, mereka harus belajar untuk menghadapi kenyataan pahit tumbuh dewasa, transeksualitas, hubungan, dan penerimaan. Dipuji sebagai sosok yang sangat serius dalam identitas gender dan perjuangan LGBT, Hourou Musuko karya Takako Shimura adalah tentang upaya Shuuichi dan Yoshino untuk temukan diri mereka yang sebenarnya ketika mereka memasuki masa puber, berteman, jatuh cinta, dan menghadapi beberapa pilihan yang sangat nyata dan sulit.