Meskipun telah satu tahun sejak Iwatobi High School Berenang Klub telah dibuat, anggota baru belum bergabung dengan klub. Sekarang bahwa Haruka Nanase dan Makoto Tachibana adalah siswa senior, bersama dengan teman-teman mereka yang lebih muda Nagisa Hazuki dan Rei Ryuugazaki, mereka harus menemukan cara untuk menarik anggota baru. Jika tidak, klub akan dipaksa untuk menutup tahun berikutnya karena kurangnya keanggotaan.Sementara itu, dengan wisuda yang akan datang, itu juga waktu untuk para senior untuk memutuskan rencana mereka untuk masa depan. Tidak seperti teman mereka Rin Matsuoka, kapten baru dari Akademi Samezuka Berenang Klub yang bertekad untuk mewujudkan impiannya menjadi seorang perenang profesional, Haruka dan Makoto tidak yakin tentang apa karir yang mereka inginkan untuk mengambil.Selanjutnya masalah muncul ketika seorang teman lama dari Rin, Sousuke Yamazaki, datang ke kota untuk belajar di Akademi Samezuka; baru-baru ini dibina perenang kedatangan menyebabkan ketegangan dalam hubungan antara dia, Rin, dan Haruka.