Setelah Makoto Naegi dan rekan-rekan korban melarikan diri Berharap Peak Academy ke dunia luar, mereka segera bergabung dengan Future Foundation, sebuah organisasi yang didedikasikan untuk memerangi putus asa. Hanya ketika semua tampaknya akan melihat ke atas, Naegi ditangkap dan diadili karena pengkhianatan karena membela berbahaya kelompok sisa-Sisa Asa. Berdiri sebelum semua masa Depan Yayasan eksekutif, ia menemukan dirinya, bersama dengan Kyouko Kirigiri dan Aoi Asahina, menghadapi yang tidak diketahui nasibnya.Masalah di tangan hanya meningkat ketika organisasi ini seharusnya tak tertembus keamanan adalah meretas oleh afamiliar wajah: Monokuma. Banyak Naegi horor, mekanik bear segera mengumumkan awal yang baru membunuh permainan, seperti saat kemudian, korban pertama muncul sebagai sinyal untuk putus asa untuk melanjutkan brutal penaklukan.Dalam kesimpulan untuk Danganronpa ini kisah tentang harapan dan putus asa, Naegi, Super Sma-Tingkat Siswa yang Beruntung, harus sekali lagi mengungkap misteri sebagai rekan dan teman-teman mulai jatuh di sekelilingnya. Namun, tidak ada lagi kelas uji coba; di antara 16 putus asa peserta, hanya ada satu pembunuh