Pada hari pertama sekolah menengah pertama, Mato Kuroi kebetulan bertemu dengan Yomi Takanashi, seorang gadis pemalu dan pemalu yang segera ia minati. Mato mencoba yang terbaik untuk bercakap-cakap dengan Yomi, ingin berteman dengannya. Pada awalnya, dia dihindari, tetapi es pecah ketika Yomi kebetulan melihat burung biru dekoratif yang melekat pada ponsel Mato, yang berasal dari buku ‘Li’l Birds At Play.’ Menemukan mereka memiliki minat yang sama, keduanya membentuk persahabatan yang kuat. Di alam semesta alternatif, gadis-gadis muda ada sebagai makhluk paralel, Mato sebagai Black ★ Rock Shooter, dan Yomi sebagai Dead Master. Entah bagaimana, apa yang terjadi di satu dunia tampaknya berdampak pada yang lain, dan tidak menyadari fakta ini, gadis-gadis itu tanpa sadar menjadi terjerat oleh untaian nasib.